El 28 de febrero de 2013, el Programa Orgánico Nacional (NOP) emitió el Documento Guía NOP 5029, "Semillas, Plántulas Anuales y Material de Siembra en la Producción de Cultivos Orgánicos". Esta guía final describe la dirección del NOP para la industria y los certificadores con respecto a cómo estos materiales pueden ser obtenidos y tratados, y especificando qué registros son necesarios para cumplir con las Normas Orgánicas Nacionales del USDA. En general, pocos cambios sustanciales afectan a los productores de cultivos anuales del CCOF.
Sin embargo, la guía aclara lo que puede ser cosechado y vendido como orgánico con respecto a la siembra y los cultivos perennes. Sólo se requieren doce meses de gestión ecológica para las plantas (tanto anuales como perennes) antes de que las plantas puedan ser vendidas o representadas como ecológicas. Sin embargo, los cultivos de esas plantas pueden ser cosechados y vendidos como ecológicos en cualquier momento. Las plántulas/transplantes anuales deben ser ecológicos, pero las plantas no ecológicas, como las coronas de fresa, las cañas de frambuesa o la madera de los brotes en la producción de uva, pueden utilizarse para producir cultivos ecológicos en los doce meses siguientes a la plantación si no se dispone de una versión ecológica.
Para utilizar la madera del brote como ejemplo, se puede cosechar un cultivo ecológico a partir de material de plantación no ecológico, incluyendo tanto la rama injertada como el resto del árbol o la vid, pero la planta injertada en sí no podría venderse como ecológica hasta que se haya gestionado de forma ecológica durante 12 meses. Tenga en cuenta que, al igual que las semillas, el material de plantación no ecológico utilizado para producir cultivos ecológicos debe cumplir los requisitos de disponibilidad comercial de 205.204(a)(1), que exigen intentar encontrar versiones ecológicas antes de utilizar material no ecológico. Deben hacerse al menos tres intentos para encontrar versiones orgánicas en la forma, calidad y cantidad necesarias de una fuente apropiada. Cuando existan obligaciones contractuales para utilizar variedades específicas, las operaciones deben demostrar esfuerzos de buena fe para cumplir con los requisitos de disponibilidad comercial de una manera que sea aplicable a su negocio y sistema.